More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0859 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
246 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  100 
 
 
246 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  46.31 
 
 
254 aa  229  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
268 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  34.41 
 
 
252 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
254 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
272 aa  165  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  36.8 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  36.03 
 
 
257 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 
252 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  34.41 
 
 
261 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.01 
 
 
259 aa  159  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  32.39 
 
 
252 aa  155  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0410  transcriptional regulator IclR-like protein  55.12 
 
 
127 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  35.22 
 
 
257 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  31.98 
 
 
258 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  35.22 
 
 
263 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
258 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  33.06 
 
 
255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.78 
 
 
255 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  34.41 
 
 
263 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  34.41 
 
 
263 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  34.41 
 
 
263 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  34.41 
 
 
263 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  34.41 
 
 
263 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.41 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  34.41 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  34.41 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  34.41 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  34.41 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  34.41 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  30.89 
 
 
262 aa  145  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  34.41 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  31.15 
 
 
248 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
284 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 
280 aa  143  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.05 
 
 
260 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  34.41 
 
 
278 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3829  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 
264 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
267 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3701  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 
263 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  29.8 
 
 
260 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
269 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  32.6 
 
 
277 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 
260 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 
268 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 
263 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 
275 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
257 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
276 aa  136  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  27.82 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  27.82 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  27.82 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
273 aa  135  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  27.82 
 
 
274 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  36.45 
 
 
246 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0508551 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  27.82 
 
 
274 aa  135  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  27.82 
 
 
274 aa  135  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
259 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  27.82 
 
 
274 aa  135  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  27.82 
 
 
274 aa  135  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  27.82 
 
 
274 aa  135  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  27.82 
 
 
274 aa  135  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  30.58 
 
 
279 aa  135  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  27.82 
 
 
274 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  34.71 
 
 
264 aa  134  9e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  27.42 
 
 
277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  32.71 
 
 
248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  30.83 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  29.46 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  34.36 
 
 
308 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 
266 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
256 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
283 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  27.82 
 
 
274 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  27.82 
 
 
274 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  30 
 
 
242 aa  131  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  27.82 
 
 
274 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  27.82 
 
 
274 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  30.57 
 
 
265 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  27.82 
 
 
274 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>