More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1156 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
256 aa  509  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  39.29 
 
 
256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 
261 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
268 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  42.97 
 
 
260 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
254 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  40.4 
 
 
259 aa  185  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  41.2 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  44.13 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  41.67 
 
 
265 aa  182  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  42.74 
 
 
262 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  43.87 
 
 
276 aa  178  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  42.4 
 
 
251 aa  178  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  42.13 
 
 
262 aa  178  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  42.8 
 
 
251 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
267 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  45.58 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  44.25 
 
 
264 aa  171  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  42.56 
 
 
265 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  44.2 
 
 
258 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  36.9 
 
 
257 aa  169  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  40.64 
 
 
251 aa  168  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  39.11 
 
 
282 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  37.3 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  38.8 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  47.01 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
260 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  40.96 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  36.11 
 
 
260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  41.43 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  44.72 
 
 
550 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  33.33 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  36.9 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  37.7 
 
 
260 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
276 aa  163  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  42.4 
 
 
273 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  43.11 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  37.14 
 
 
254 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
257 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  35.2 
 
 
263 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  35.89 
 
 
280 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  35.6 
 
 
263 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  38.58 
 
 
279 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
260 aa  158  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  35.2 
 
 
263 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  34.54 
 
 
263 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  32.53 
 
 
257 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
259 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  39.44 
 
 
265 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.94 
 
 
263 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  34.94 
 
 
263 aa  156  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  34.94 
 
 
263 aa  156  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  34.94 
 
 
263 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  34.94 
 
 
263 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  34.94 
 
 
263 aa  156  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
263 aa  156  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  34.94 
 
 
263 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  38.31 
 
 
249 aa  155  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 
252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 
257 aa  155  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  36 
 
 
263 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  38.49 
 
 
284 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  36 
 
 
263 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  36 
 
 
263 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  33.87 
 
 
295 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  36.18 
 
 
255 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  34.65 
 
 
252 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  34 
 
 
265 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  34.14 
 
 
260 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
265 aa  152  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 
252 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
261 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  34 
 
 
263 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  34 
 
 
263 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  44.2 
 
 
283 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  34 
 
 
263 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  36.29 
 
 
290 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  34 
 
 
263 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  34 
 
 
263 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  34 
 
 
263 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
283 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  34.94 
 
 
278 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  36.4 
 
 
271 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  36 
 
 
256 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  36 
 
 
256 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  36.51 
 
 
251 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  36 
 
 
271 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 
271 aa  148  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  36 
 
 
271 aa  148  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  36 
 
 
271 aa  148  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  36 
 
 
271 aa  148  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  36 
 
 
271 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  38.15 
 
 
286 aa  148  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  35.48 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>