More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1318 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
275 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  46.85 
 
 
273 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  46.96 
 
 
273 aa  225  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  45.04 
 
 
284 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  43.7 
 
 
269 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  43.31 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  45.42 
 
 
277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  42.8 
 
 
282 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  44.11 
 
 
277 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  41.54 
 
 
280 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  41.54 
 
 
280 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  41.54 
 
 
280 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  44.22 
 
 
276 aa  205  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  43.43 
 
 
274 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  43.43 
 
 
274 aa  205  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  43.43 
 
 
274 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  43.43 
 
 
274 aa  205  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  43.43 
 
 
274 aa  205  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  43.43 
 
 
274 aa  205  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  43.43 
 
 
274 aa  205  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  43.43 
 
 
274 aa  205  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  41.13 
 
 
280 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  45.08 
 
 
279 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  43.03 
 
 
275 aa  203  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  42.63 
 
 
274 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  42.63 
 
 
274 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  42.63 
 
 
274 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  42.29 
 
 
277 aa  202  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  42.63 
 
 
274 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  41.83 
 
 
276 aa  202  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  42 
 
 
279 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  42.63 
 
 
274 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  40.32 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  44.19 
 
 
276 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  42.17 
 
 
277 aa  191  8e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
284 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  42.31 
 
 
276 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  38.78 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  38.37 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  38.37 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  38.37 
 
 
271 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  38.37 
 
 
271 aa  183  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  38.37 
 
 
271 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  38.37 
 
 
271 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  38.37 
 
 
271 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  38.37 
 
 
271 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
276 aa  181  9.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
268 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  33.87 
 
 
256 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0570  DNA-binding transcriptional repressor AllR  37.5 
 
 
272 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0563  DNA-binding transcriptional repressor AllR  37.5 
 
 
272 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0624  DNA-binding transcriptional repressor AllR  37.5 
 
 
272 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10241  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0565  DNA-binding transcriptional repressor AllR  37.5 
 
 
272 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  36.8 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  36.9 
 
 
259 aa  169  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  37.94 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  36.9 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  37.2 
 
 
280 aa  162  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
261 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
262 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
253 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
260 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 
257 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
261 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
283 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.02 
 
 
257 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
267 aa  145  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  29.13 
 
 
257 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 
260 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  35.48 
 
 
254 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  34.63 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  37.3 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  36.4 
 
 
248 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  35 
 
 
308 aa  139  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  28.86 
 
 
252 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  30.43 
 
 
260 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  31.8 
 
 
254 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
255 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  32.92 
 
 
242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  36.24 
 
 
276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0481  transcriptional regulator IclR  35.96 
 
 
284 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 
290 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  34.15 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  29.64 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  31.43 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 
254 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
260 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  35.53 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  31.95 
 
 
259 aa  128  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>