More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0822 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
258 aa  525  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  42.45 
 
 
254 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  40.74 
 
 
251 aa  190  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  40.74 
 
 
255 aa  186  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  39.6 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  41.02 
 
 
256 aa  180  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  35.8 
 
 
266 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  37.85 
 
 
255 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 
255 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  36.36 
 
 
258 aa  175  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  39.76 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  40.08 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  37.3 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  34.94 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  35.04 
 
 
258 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  38.78 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  34.96 
 
 
254 aa  165  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  37.3 
 
 
263 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  34.52 
 
 
272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  38.52 
 
 
262 aa  160  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  36.33 
 
 
258 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  42.26 
 
 
258 aa  159  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  38.68 
 
 
261 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  37.1 
 
 
268 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  34.44 
 
 
251 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  35.59 
 
 
250 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  38.1 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  35.8 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  35.12 
 
 
249 aa  149  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  37.38 
 
 
262 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  32.42 
 
 
262 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  34.15 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  34.39 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  36.67 
 
 
254 aa  145  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  38.62 
 
 
256 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  35.62 
 
 
281 aa  142  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  35.66 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 
258 aa  139  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  34.16 
 
 
275 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  32.94 
 
 
270 aa  138  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  34.66 
 
 
257 aa  135  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  35.77 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 
261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 
259 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.14 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  34.94 
 
 
277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  36.95 
 
 
248 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  35.34 
 
 
276 aa  123  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  30.64 
 
 
269 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
272 aa  115  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
263 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
259 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  31.03 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  35.24 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  31.03 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  31.03 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  31.03 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  31.03 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  32.77 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  30.54 
 
 
276 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  34.05 
 
 
257 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  30.6 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  30.6 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  30.6 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  30.6 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  30.6 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  30.6 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  30.6 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  30.6 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
251 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  29.96 
 
 
254 aa  108  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.49 
 
 
256 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  29.71 
 
 
277 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
275 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  31.06 
 
 
273 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  32.58 
 
 
249 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
283 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.41 
 
 
255 aa  105  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  29.29 
 
 
280 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  29.29 
 
 
280 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 
251 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  29.29 
 
 
280 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
280 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  30.43 
 
 
277 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
284 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  32.43 
 
 
290 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  29.57 
 
 
275 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  30 
 
 
277 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
246 aa  102  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  28.19 
 
 
246 aa  102  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.64 
 
 
256 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.64 
 
 
256 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.64 
 
 
271 aa  102  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.64 
 
 
271 aa  102  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>