More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0543 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  100 
 
 
271 aa  551  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
271 aa  551  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  551  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  100 
 
 
271 aa  551  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  100 
 
 
271 aa  551  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  100 
 
 
271 aa  551  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  99.63 
 
 
271 aa  550  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  99.61 
 
 
256 aa  518  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  99.61 
 
 
256 aa  518  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0624  DNA-binding transcriptional repressor AllR  91.04 
 
 
272 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10241  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0563  DNA-binding transcriptional repressor AllR  91.04 
 
 
272 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0570  DNA-binding transcriptional repressor AllR  91.04 
 
 
272 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0565  DNA-binding transcriptional repressor AllR  91.04 
 
 
272 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.988218 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  42.42 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  42.42 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  42.42 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  42.42 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  42.42 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  42.42 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  42.42 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  42.42 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  42.05 
 
 
274 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  42.05 
 
 
274 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  42.05 
 
 
274 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  42.05 
 
 
274 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  42.05 
 
 
274 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  42.58 
 
 
277 aa  218  8.999999999999998e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  39.93 
 
 
280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  39.93 
 
 
280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  39.93 
 
 
280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  41.29 
 
 
277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  42.11 
 
 
275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  41.83 
 
 
276 aa  209  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  43.12 
 
 
284 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  42.74 
 
 
276 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  40.07 
 
 
277 aa  205  8e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  41.54 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  38.78 
 
 
280 aa  188  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
275 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  36.5 
 
 
295 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  37.79 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
284 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  34.5 
 
 
265 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  37.45 
 
 
279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  33.72 
 
 
273 aa  165  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  34.59 
 
 
276 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  35.51 
 
 
279 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  33.83 
 
 
276 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
267 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
276 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.45 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
282 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
261 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0481  transcriptional regulator IclR  36.96 
 
 
284 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 
256 aa  148  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
272 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
280 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 
259 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  32.24 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
263 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
254 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 
261 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.3 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  36.12 
 
 
260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  34.41 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  33.21 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  32.51 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  32.93 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
246 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  28.16 
 
 
246 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  31.13 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  31.87 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  30.13 
 
 
263 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
263 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
251 aa  125  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 
252 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 
269 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
259 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  29.27 
 
 
260 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  30.13 
 
 
263 aa  123  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.13 
 
 
255 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 
251 aa  122  5e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 
266 aa  122  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
262 aa  122  7e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  32.94 
 
 
265 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  29.27 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  35.06 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  28.74 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>