More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3853 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
263 aa  521  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  58.06 
 
 
266 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  58.06 
 
 
266 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  54.05 
 
 
269 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  52.8 
 
 
269 aa  259  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  53.36 
 
 
277 aa  247  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  54.37 
 
 
272 aa  229  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  50.6 
 
 
262 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  50.2 
 
 
262 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  50.2 
 
 
262 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
260 aa  215  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  45.63 
 
 
267 aa  215  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  49.36 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  44.44 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  38.06 
 
 
259 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 
261 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 
256 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  35.08 
 
 
260 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  35.08 
 
 
260 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
254 aa  155  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  34.68 
 
 
260 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
260 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  35.89 
 
 
260 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  32.53 
 
 
252 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
262 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
267 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 
260 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
259 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
276 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  38.21 
 
 
277 aa  143  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  33.73 
 
 
263 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
261 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
265 aa  142  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
268 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  34.94 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  30.98 
 
 
251 aa  139  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  35.22 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  34.01 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  34.01 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  34.01 
 
 
271 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  34.01 
 
 
271 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  34.01 
 
 
271 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  34.01 
 
 
271 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  35.63 
 
 
266 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  34.01 
 
 
271 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  34.01 
 
 
271 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  34.01 
 
 
271 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
260 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 
255 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  38.06 
 
 
290 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  32.68 
 
 
276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
282 aa  136  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  37.45 
 
 
257 aa  135  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  34.52 
 
 
257 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  37.65 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  37.45 
 
 
256 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
284 aa  135  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
280 aa  135  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 
264 aa  135  9e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  34.41 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  33.33 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 
265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  37.24 
 
 
258 aa  132  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
268 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  32.8 
 
 
277 aa  131  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  32 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  32 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  32 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  32 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  32 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  32 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  32 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  32 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  34.21 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  31.58 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  31.87 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  31.87 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  31.87 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  31.98 
 
 
263 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  31.98 
 
 
263 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  31.98 
 
 
263 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  31.98 
 
 
263 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  31.98 
 
 
263 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 
263 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  32.8 
 
 
276 aa  128  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 
252 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 
263 aa  128  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  31.58 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  30.68 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  30.68 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>