More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0368 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  100 
 
 
277 aa  567  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  87.73 
 
 
277 aa  504  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  85.82 
 
 
277 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  85.09 
 
 
276 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  79.35 
 
 
276 aa  460  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  78.91 
 
 
280 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  78.91 
 
 
280 aa  455  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  78.91 
 
 
280 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  76.9 
 
 
274 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  76.9 
 
 
274 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  76.9 
 
 
274 aa  435  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  76.9 
 
 
274 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  76.9 
 
 
274 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  76.9 
 
 
274 aa  435  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  76.9 
 
 
274 aa  435  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  76.9 
 
 
274 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  76.53 
 
 
274 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  76.53 
 
 
274 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  76.53 
 
 
274 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  76.53 
 
 
274 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  76.53 
 
 
274 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  76.17 
 
 
275 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
284 aa  234  8e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  45.42 
 
 
275 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  41.29 
 
 
271 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  41.29 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  41.29 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  41.29 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  41.29 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  41.29 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  41.29 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  42.51 
 
 
256 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  42.51 
 
 
256 aa  209  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  43.43 
 
 
279 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  41.39 
 
 
273 aa  201  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0565  DNA-binding transcriptional repressor AllR  42.05 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0563  DNA-binding transcriptional repressor AllR  42.05 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0624  DNA-binding transcriptional repressor AllR  42.05 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10241  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0570  DNA-binding transcriptional repressor AllR  42.05 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  42.22 
 
 
295 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 
273 aa  192  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  38.89 
 
 
280 aa  186  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
280 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  38.25 
 
 
260 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  39.35 
 
 
276 aa  176  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  37.36 
 
 
277 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
282 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
284 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  36.4 
 
 
265 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  36.36 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  37.45 
 
 
259 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  35.74 
 
 
276 aa  161  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  36.8 
 
 
279 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0481  transcriptional regulator IclR  35.23 
 
 
284 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
276 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.66 
 
 
256 aa  158  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
267 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  35.77 
 
 
255 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  34.27 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
262 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  37.14 
 
 
248 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  36.99 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  33.05 
 
 
254 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
272 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
283 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 
260 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
261 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
254 aa  139  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 
252 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
259 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
260 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  32.39 
 
 
255 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.33 
 
 
260 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
256 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  38.63 
 
 
257 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  35.06 
 
 
257 aa  135  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  35.1 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  34.92 
 
 
290 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 
260 aa  133  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  33.71 
 
 
265 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
246 aa  132  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  27.42 
 
 
246 aa  132  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  32.8 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  35.86 
 
 
280 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
258 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>