More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3666 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
267 aa  543  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  45.08 
 
 
268 aa  226  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  40.22 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  41.02 
 
 
281 aa  189  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  41.5 
 
 
258 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  40.94 
 
 
261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 
256 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  37.35 
 
 
266 aa  176  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  38.1 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  36.19 
 
 
263 aa  170  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  39.22 
 
 
277 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  37.8 
 
 
258 aa  168  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  37.4 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  36.69 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  36.72 
 
 
270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  38.89 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  36.61 
 
 
255 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  37.65 
 
 
254 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  37.86 
 
 
255 aa  159  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 
254 aa  158  7e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  37.2 
 
 
258 aa  158  9e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  35.63 
 
 
258 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  37.01 
 
 
255 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  37.9 
 
 
251 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 
262 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  33.97 
 
 
272 aa  155  9e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  35.18 
 
 
257 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  34.01 
 
 
257 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  33.98 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  38.31 
 
 
251 aa  145  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  34.78 
 
 
262 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
262 aa  142  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  35.66 
 
 
258 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  34.76 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
254 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  31.6 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  30.43 
 
 
257 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  31.18 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  32.55 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 
249 aa  109  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.34 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
272 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
256 aa  105  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 
261 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
275 aa  102  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
267 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 
257 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.86 
 
 
259 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 
248 aa  99  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
276 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0430  IclR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0855586  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  30.77 
 
 
276 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 
258 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  26.84 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  28.22 
 
 
276 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 
269 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
550 aa  90.1  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
268 aa  89.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  28.88 
 
 
299 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
254 aa  89.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
276 aa  89  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 
253 aa  88.6  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  29.71 
 
 
264 aa  88.6  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  25.4 
 
 
246 aa  88.6  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
246 aa  88.6  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  27.09 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4876  transcriptional regulator, IclR family  43.31 
 
 
127 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  30.87 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  27.8 
 
 
254 aa  87  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  26.72 
 
 
255 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  30.47 
 
 
251 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 
280 aa  85.5  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  29.69 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.04 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  27.35 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  28.06 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11734  transcriptional regulator  30.83 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  26.78 
 
 
260 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  26.99 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  25.97 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  25.42 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  29.3 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  30.51 
 
 
262 aa  82  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6106  IclR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.5704 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.82 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.82 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.82 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>