More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11734 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11734  transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  513  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5059  transcriptional regulator IclR-like protein  39.39 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.487025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2866  regulatory protein, IclR  39.27 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51530  multidrug efflux pump operon transcriptional regulator protein  37.4 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3492  regulatory proteins, IclR  37.65 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1222  transcriptional regulator, IclR family  37.33 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0155  regulatory proteins, IclR  37.87 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1334  IclR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2558  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11801  transcriptional regulator  40.79 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128821 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  36.21 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  30.34 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0325  regulatory proteins, IclR  37.96 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.339851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 256 aa  109  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  35.14 
 
 		 266 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 272 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  36.49 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  35.35 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4051  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  30.8 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.726111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3990  hth-type tranScriptional regulator yiaj  30.8 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3865  HTH-type transcriptional regulator  30.8 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3945  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  30.8 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3881  hth-type tranScriptional regulator yiaj  30.8 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  32.06 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  33.77 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  32.06 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  32.06 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.98 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.93 
 
 		 254 aa  102  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  34.84 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  34.84 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  34.78 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  30.25 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  31.75 
 
 		 270 aa  99.4  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 268 aa  99  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.76 
 
 		 261 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2854  transcriptional regulator, IclR family  37.56 
 
 		 285 aa  99  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  34.06 
 
 		 280 aa  98.6  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  34.62 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  30.18 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.06 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  35.84 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  29.82 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  26.64 
 
 		 280 aa  95.5  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  30.84 
 
 		 255 aa  95.5  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  26.64 
 
 		 280 aa  95.5  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  26.64 
 
 		 280 aa  95.5  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 		 257 aa  95.1  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0516  transcriptional regulator, IclR family  32.35 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  29.73 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 283 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  35.29 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  32.3 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  32 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.88 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  35.11 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  36.58 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  35.77 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 267 aa  92.4  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  36.7 
 
 		 257 aa  92.4  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  30.29 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 266 aa  92  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>