More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4369 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  537  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  49.2 
 
 		 261 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  50.62 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  51.03 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  49.38 
 
 		 268 aa  214  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2795  transcriptional regulator, IclR family  43.44 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2053  IclR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20720  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439734  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 272 aa  132  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.96 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  35.32 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  34.82 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  35.56 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.33 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1507  transcriptional regulator, IclR family  32.59 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.66 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  36.2 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0681  regulatory proteins, IclR  37.22 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.93 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  31.43 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 257 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 265 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  31.8 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.98 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  30.77 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  35.14 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  33.63 
 
 		 249 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  29.3 
 
 		 254 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  28.63 
 
 		 274 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  28.63 
 
 		 274 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  28.63 
 
 		 274 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  28.63 
 
 		 274 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  28.63 
 
 		 274 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  28.69 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  30.58 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  33.97 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  33.66 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0340  IclR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  28.23 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  32.29 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  28.23 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  28.23 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  28.23 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  28.23 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  28.23 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  28.23 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  28.23 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2210  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.871599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  34.85 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  29.63 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  33.47 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  30.36 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28.46 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28.46 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  28.74 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  35.37 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  28.03 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28.46 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  28.85 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  31.05 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3829  transcriptional regulator, IclR family  34.08 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.32 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  28.45 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.27 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  30.42 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>