More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0533 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 247 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  40.09 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  38.93 
 
 		 255 aa  161  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  34.84 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  36.99 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  34.82 
 
 		 254 aa  151  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  38.29 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  38.64 
 
 		 265 aa  148  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  37.84 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  38.01 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  39.27 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  35.12 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  42.06 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  35.51 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  36.94 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  36.99 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  36.7 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  35.16 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  36.24 
 
 		 257 aa  134  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  38.57 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  35.16 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  41.67 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  37.3 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  32.29 
 
 		 265 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  35.51 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  32.43 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  36.53 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  35.43 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  36.53 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  37.07 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  35.56 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  31.96 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  40.65 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.31 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  32.87 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  29.67 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  39.09 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  39.61 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  35.87 
 
 		 277 aa  122  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  38.68 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  38.49 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 269 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  32.87 
 
 		 263 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  40.09 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  37.04 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  31.94 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  31.94 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  39.55 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  34.68 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 308 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 286 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  33.8 
 
 		 290 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  34.25 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 324 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  31.02 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  32.27 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  37.96 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.02 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  31.02 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  31.02 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  32.49 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  31.02 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  31.02 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  32.49 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  32.49 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  32.49 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  31.02 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  31.02 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  34.3 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>