More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2032 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
268 aa  543  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  66.8 
 
 
258 aa  347  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  66.8 
 
 
258 aa  345  4e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  44.84 
 
 
267 aa  201  9e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
253 aa  195  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
291 aa  179  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  37.75 
 
 
256 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  36.72 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  38.15 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 
261 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  37.75 
 
 
275 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  36.65 
 
 
260 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2381  IclR family transcriptional regulator  39.11 
 
 
279 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  35.06 
 
 
260 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  35.2 
 
 
260 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 
252 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  37.45 
 
 
277 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.66 
 
 
257 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 
260 aa  149  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  37.61 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
261 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
260 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  38.56 
 
 
257 aa  145  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  38.67 
 
 
308 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
265 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
259 aa  142  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
246 aa  142  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  32.39 
 
 
246 aa  142  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  38.43 
 
 
276 aa  142  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  34 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  36.89 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  31.05 
 
 
248 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  36 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  34.14 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  36.44 
 
 
254 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  35.43 
 
 
252 aa  135  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  33.93 
 
 
260 aa  135  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  36.51 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  36.73 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  37.19 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.86 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  41.38 
 
 
255 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  36.52 
 
 
280 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
263 aa  131  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  37.25 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
267 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  26.1 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  29.27 
 
 
257 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  38.99 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  34.01 
 
 
277 aa  128  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  34.54 
 
 
273 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  32.4 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  35.46 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
270 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  34.82 
 
 
270 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
270 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 
263 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
270 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
270 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
270 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
270 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
270 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 
249 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
258 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
269 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
269 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
269 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
269 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
238 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  34.41 
 
 
268 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 
266 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
283 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
250 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 
267 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  37.67 
 
 
253 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  36.28 
 
 
252 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 
263 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
261 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 
263 aa  122  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 
247 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
319 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  33.62 
 
 
263 aa  122  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>