More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0315 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  617  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  99.35 
 
 		 324 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 286 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  81.59 
 
 		 276 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  76.53 
 
 		 299 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  48.43 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  44.07 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 249 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 249 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  42.86 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  41.42 
 
 		 246 aa  152  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  39.83 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 238 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  43.95 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  36.48 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  41.05 
 
 		 254 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  34.63 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 267 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.22 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 272 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  38.86 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  36.86 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  36.82 
 
 		 259 aa  116  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  37.3 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  35.4 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  34.53 
 
 		 252 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.96 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  32 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  36.15 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  34.34 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4911  IclR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406508  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  38.35 
 
 		 249 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  28.44 
 
 		 248 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03724  putative transcriptional regulator  36.87 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03673  hypothetical protein  36.87 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  37.29 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4214  IclR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389286 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  36.48 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  34.45 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  34.19 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.2 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  36.09 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  33.62 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  30.54 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  36.82 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 268 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 269 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2490  IclR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0410  IclR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.616756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3452  IclR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 324 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3490  IclR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 324 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3295  IclR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1270  IclR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3489  transcriptional regulator  36.1 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  37.37 
 
 		 234 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  37.37 
 
 		 234 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  37.37 
 
 		 234 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  35.02 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  36.05 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 262 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  35.93 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1175  IclR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 350 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  36.05 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 261 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  30.17 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>