More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2185 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 259 aa  491  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  54.15 
 
 		 270 aa  241  9e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  54.76 
 
 		 249 aa  241  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  56.35 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  55.56 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  55.02 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  55.51 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  55.51 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  55.51 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  55.05 
 
 		 215 aa  209  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  48.21 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  49.4 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  43.27 
 
 		 252 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  50 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  36.4 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4044  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  40.89 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  43.78 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  40.09 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  40.65 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 249 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 249 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  38.5 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 		 272 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3839  transcriptional regulator, IclR family  36.55 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  34.52 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  31.71 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3485  IclR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 272 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  36.82 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 		 256 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  39.29 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  41.84 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  27.92 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.43 
 
 		 255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  33.63 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  36.78 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  33.47 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  36.51 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  35.5 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  32.38 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 252 aa  109  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  34.98 
 
 		 259 aa  109  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 267 aa  108  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  34.5 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  36.02 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  36.36 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  34.69 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  31.97 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  38.97 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  34.54 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  36.18 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  35.21 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  35.29 
 
 		 266 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  34.96 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  35.96 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.17 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  35.29 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  35.29 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 254 aa  102  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 267 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  34.33 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>