More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1725 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 279 aa  551  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  43.51 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  41.41 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  42.68 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  40.87 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  42.11 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  40.08 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  40.08 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  40.08 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  44.59 
 
 		 254 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  40.18 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  38.98 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 264 aa  142  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3839  transcriptional regulator, IclR family  36.59 
 
 		 247 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  35.83 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  39 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  40.27 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  37.85 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  36.8 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  36.59 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  35.05 
 
 		 264 aa  122  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4044  IclR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  34.02 
 
 		 252 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  28.98 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 267 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  30.24 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 		 280 aa  108  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4088  transcriptional regulator, IclR family  32.4 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.855439  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  32.65 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.64 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 324 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 267 aa  98.6  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  34.12 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  26.64 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3485  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 276 aa  95.9  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  31.08 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  31.1 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  29.66 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2388  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000136805  decreased coverage  0.000110172 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 256 aa  93.2  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  31.46 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.94 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  31.46 
 
 		 265 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  31.46 
 
 		 266 aa  92.4  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  29.25 
 
 		 252 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  30.66 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  25.22 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  27.39 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  27.78 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  27.46 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  31.82 
 
 		 294 aa  89.7  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  30.91 
 
 		 259 aa  90.1  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  27.76 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 267 aa  89  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  29.13 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  31.47 
 
 		 242 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  30.66 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  27.71 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 249 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 249 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  27.68 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.17 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>