More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0569 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
251 aa  518  1e-146  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  34.94 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 
261 aa  164  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  37.94 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  35.57 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
268 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.33 
 
 
252 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  34.39 
 
 
263 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  34.39 
 
 
263 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  34.39 
 
 
263 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  34.39 
 
 
263 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  34.39 
 
 
263 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  34.39 
 
 
263 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
263 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  32.93 
 
 
257 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.6 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  33.6 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  33.6 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  33.6 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  33.6 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  33.6 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 
265 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.68 
 
 
257 aa  146  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  33.6 
 
 
263 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  32.41 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  27.24 
 
 
277 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 
263 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  33.87 
 
 
278 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
263 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  33.2 
 
 
263 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
263 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 
259 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  33.2 
 
 
263 aa  142  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
269 aa  142  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  36.07 
 
 
254 aa  142  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
292 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
254 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
263 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  30.83 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
257 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
262 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  30.12 
 
 
290 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 
256 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.38 
 
 
267 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 
266 aa  135  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 
266 aa  135  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  30.04 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
250 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  30.45 
 
 
273 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  31.53 
 
 
255 aa  132  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
261 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
260 aa  131  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
276 aa  131  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  28.1 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  25.1 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
262 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 
269 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  31.1 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 
249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  30.49 
 
 
260 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  27.69 
 
 
250 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 
277 aa  128  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  27.69 
 
 
250 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  28.1 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  30.12 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  30 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.55 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  28.23 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
260 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
250 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 
290 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  30.24 
 
 
266 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
256 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
267 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  31.14 
 
 
252 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  32.89 
 
 
280 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  32.89 
 
 
280 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  32.89 
 
 
280 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
261 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  30.7 
 
 
253 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>