More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3534 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 248 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  56.35 
 
 		 259 aa  240  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  54.8 
 
 		 270 aa  235  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  52.21 
 
 		 249 aa  234  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  53.56 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  51.93 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  51.93 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  51.93 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  49.4 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  53.02 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  49.59 
 
 		 266 aa  185  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  44.18 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  45.3 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 238 aa  154  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  37.96 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  43.44 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  46.94 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  39.92 
 
 		 252 aa  148  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  42.62 
 
 		 272 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  42.5 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  39.08 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3485  IclR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  40.73 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  37.19 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  35.14 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  33.49 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.44 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  30.04 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3839  transcriptional regulator, IclR family  36.48 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  35.15 
 
 		 277 aa  118  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  40.09 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  34.98 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  33.61 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  34.63 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  32.2 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  34.62 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  32.65 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.75 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  34.96 
 
 		 254 aa  111  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 259 aa  111  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4044  IclR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  33.07 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  35.89 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 291 aa  109  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 267 aa  108  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 268 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03724  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  35.21 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4214  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 284 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389286 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03673  hypothetical protein  32.14 
 
 		 284 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.04 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  36.07 
 
 		 299 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  33.17 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  32.68 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  33.17 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  31.56 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  30.96 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  33.17 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>