More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2885 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  61.18 
 
 		 252 aa  289  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  50.42 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  50.42 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  47.9 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  46.84 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  46.3 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  40.68 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  40.59 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  44.54 
 
 		 248 aa  154  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  40.68 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  41.3 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  40.85 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 264 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  38.14 
 
 		 276 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  41.91 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  37.66 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 286 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  38.33 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  36.97 
 
 		 254 aa  138  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  40.68 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  38.79 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  38.79 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  38.79 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  38.79 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 268 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  34.53 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  38.08 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 258 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  32.89 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.3 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.38 
 
 		 259 aa  118  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  40.26 
 
 		 256 aa  118  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  35.68 
 
 		 262 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  37.61 
 
 		 242 aa  118  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  38.43 
 
 		 215 aa  118  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  36.49 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  40.08 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  38.57 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  30.99 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.44 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  34.58 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  36.44 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  34.09 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 317 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  39.13 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  33.94 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  34.71 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  32.14 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  37.9 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  35.11 
 
 		 277 aa  108  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2768  IclR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 299 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1991  regulatory proteins, IclR  36.07 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0527624  normal  0.0427076 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3489  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 350 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  34.89 
 
 		 262 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 		 272 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3490  IclR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 324 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  34.23 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3295  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3452  IclR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 324 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880887  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3415  transcriptional regulator, IclR family  35.6 
 
 		 330 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257423  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0410  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.616756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2490  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1270  IclR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0542  IclR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 290 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0134  IclR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 365 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102301  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0617  IclR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 299 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0585  IclR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 299 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  0.0114736 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  32.64 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1175  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 350 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 269 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>