More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26680 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  55.87 
 
 		 254 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  54.15 
 
 		 259 aa  240  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  54.8 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  48.8 
 
 		 249 aa  215  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  47.39 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  47.66 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  47.66 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  47.66 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  45.57 
 
 		 260 aa  189  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  48.96 
 
 		 266 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  47.72 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  47.22 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  41.42 
 
 		 252 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  42.15 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 261 aa  149  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 249 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 249 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  38.43 
 
 		 272 aa  142  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  38.04 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3839  transcriptional regulator, IclR family  37.14 
 
 		 247 aa  138  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4088  transcriptional regulator, IclR family  36.09 
 
 		 275 aa  138  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.855439  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  38.29 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.41 
 
 		 254 aa  135  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  39.33 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3485  IclR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  36.89 
 
 		 246 aa  132  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 270 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4044  IclR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  36.71 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  36.74 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  40.83 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 286 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  34.76 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  34.29 
 
 		 259 aa  122  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  33.47 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  32.56 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 259 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  34.87 
 
 		 255 aa  118  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2388  transcriptional regulator, IclR family  34.35 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000136805  decreased coverage  0.000110172 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  36.88 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  32.23 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2376  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157038  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  36.7 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  34.32 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  29.69 
 
 		 250 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  29.71 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  36.18 
 
 		 266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  28.82 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  29.26 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  32.34 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  34.96 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2063  transcriptional regulator IclR  30.42 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0428372  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 271 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  36.97 
 
 		 265 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  36.97 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  28.82 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  35.71 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  32.89 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  36.82 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  34.84 
 
 		 255 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  36.86 
 
 		 296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 270 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 270 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 270 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  34.6 
 
 		 270 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 269 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>