More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5822 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0541  transcriptional regulator, IclR family  51.36 
 
 		 261 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.765211  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6621  transcriptional regulator, IclR family  52.57 
 
 		 273 aa  242  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4911  IclR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406508  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0542  IclR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3415  transcriptional regulator, IclR family  48.21 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257423  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1175  IclR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  44.18 
 
 		 269 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0585  IclR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  0.0114736 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0134  IclR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 365 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102301  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0617  IclR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2490  IclR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 305 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1270  IclR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1991  regulatory proteins, IclR  43.78 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0527624  normal  0.0427076 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3489  transcriptional regulator  44.77 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3452  IclR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880887  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2768  IclR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0410  IclR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.616756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3295  IclR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3490  IclR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03724  putative transcriptional regulator  43.33 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03673  hypothetical protein  43.33 
 
 		 284 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4214  IclR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 284 aa  200  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51350  transcriptional regulator protein DgoR  46.15 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4121  IclR family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101535  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0518  IclR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689346  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0542  IclR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  40.47 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0393  transcriptional regulator, IclR family  41.37 
 
 		 261 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.393158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  32.6 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 264 aa  126  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 267 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  33.88 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  32.5 
 
 		 252 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  34.54 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 324 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  35.25 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  32.65 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 		 249 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  29.51 
 
 		 265 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  38.05 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  37.32 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  31.92 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 252 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  36.24 
 
 		 296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.23 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  36.32 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  30.61 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  34.26 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 		 248 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.63 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  30.8 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  33.62 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  30.87 
 
 		 263 aa  106  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  32.39 
 
 		 286 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  30.8 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  30.8 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  29.13 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  32.62 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  30.8 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  30.8 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  30.8 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27200  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0677925  normal  0.469138 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  29.57 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.23 
 
 		 255 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  30.43 
 
 		 263 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  32.37 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  33.46 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  30.22 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  28.7 
 
 		 263 aa  102  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  31.47 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>