More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6621 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6621  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 273 aa  548  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4911  IclR family transcriptional regulator  76.54 
 
 		 276 aa  378  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406508  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2768  IclR family transcriptional regulator  53.48 
 
 		 299 aa  260  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  55.2 
 
 		 317 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  53.48 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0134  IclR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 365 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102301  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0617  IclR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0585  IclR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  0.0114736 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2490  IclR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 305 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1175  IclR family transcriptional regulator  55.78 
 
 		 350 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0410  IclR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.616756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3295  IclR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1270  IclR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3452  IclR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3490  IclR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3489  transcriptional regulator  55.38 
 
 		 350 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  53.97 
 
 		 269 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1991  regulatory proteins, IclR  52.17 
 
 		 269 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0527624  normal  0.0427076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3415  transcriptional regulator, IclR family  54.4 
 
 		 330 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257423  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0542  IclR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 290 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4121  IclR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 267 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101535  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  52.57 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0542  IclR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 299 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0518  IclR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 299 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689346  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0541  transcriptional regulator, IclR family  53.63 
 
 		 261 aa  241  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.765211  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51350  transcriptional regulator protein DgoR  50.4 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03724  putative transcriptional regulator  47.95 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4214  IclR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389286 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03673  hypothetical protein  47.95 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  41.09 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0393  transcriptional regulator, IclR family  42.91 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.393158 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  36.4 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  30.92 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  31.4 
 
 		 265 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  35.6 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.95 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 267 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  30.11 
 
 		 267 aa  119  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.14 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  30.49 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  35.21 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  35.06 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  31.91 
 
 		 265 aa  108  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 249 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.57 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  31.37 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.27 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  30.95 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  34.66 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  27.52 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4675  transcriptional regulator, IclR family  34.78 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236119  normal  0.713971 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 282 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  29.34 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 282 aa  102  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  29.14 
 
 		 272 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 261 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  29.41 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  29.14 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  29.41 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  28.96 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.52 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  27.52 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  27.52 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  28.96 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  27.52 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  27.52 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2428  putative transcriptional regulator  31.05 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  27.52 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2477  putative transcriptional regulator  31.05 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2520  putative transcriptional regulator  31.05 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  36.57 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  27.03 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>