More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5478 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 249 aa  500  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  54.51 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  48.79 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  40.09 
 
 		 257 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  39.82 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  39.38 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  38.53 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.44 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  36.44 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  36.44 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  36.44 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  37.17 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  36.44 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  36.44 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  37.44 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  35.84 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  35.84 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  35.84 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  35.84 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  35.84 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 262 aa  144  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  35.56 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  34.67 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  35.56 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  35.94 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  37.9 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  37.25 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  35.11 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  35.71 
 
 		 278 aa  135  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 258 aa  135  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  39.29 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 254 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  34.42 
 
 		 252 aa  134  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  35.06 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  37.5 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 269 aa  131  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  34.22 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  34.22 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  32.89 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  32.93 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  35.51 
 
 		 280 aa  128  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  38.73 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  36.73 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  35.19 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  34.6 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  39.76 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  33.98 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  36.48 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  36.82 
 
 		 281 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  34.12 
 
 		 272 aa  122  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  40.62 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  34.25 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  34 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  34.52 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  33.48 
 
 		 271 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  35.19 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  30.87 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  35.14 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  34.55 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  34.58 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  32.58 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2477  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 257 aa  118  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2520  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 260 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2428  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 260 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  38.59 
 
 		 257 aa  118  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  38.91 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2532  putative transcriptional regulator  31.02 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.221562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  30.77 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  37.79 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 258 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  30.25 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2636  putative transcriptional regulator  31.02 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  32.29 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  29.07 
 
 		 250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  33.78 
 
 		 249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>