More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1855 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
280 aa  560  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 
256 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  40.78 
 
 
261 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  38.87 
 
 
257 aa  192  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  38.49 
 
 
272 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
260 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  38.1 
 
 
259 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  38.13 
 
 
260 aa  185  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
260 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  42.21 
 
 
267 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  37.89 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  38.28 
 
 
260 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  38.28 
 
 
260 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
254 aa  175  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  39.84 
 
 
265 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  41.37 
 
 
260 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
265 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  38.25 
 
 
268 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  38.19 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  35.47 
 
 
290 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  40.53 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
275 aa  162  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  35.63 
 
 
257 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  38.49 
 
 
254 aa  162  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
257 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
267 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
292 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
261 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  35.41 
 
 
263 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  34.01 
 
 
252 aa  155  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  36.65 
 
 
277 aa  155  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  37.05 
 
 
255 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  35.52 
 
 
265 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 
266 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 
266 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
249 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  33.6 
 
 
279 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  35.6 
 
 
252 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  34.52 
 
 
263 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  35.2 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  33.88 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  39.68 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  32.68 
 
 
253 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  32.06 
 
 
291 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  32.06 
 
 
291 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
291 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
283 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
261 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
263 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  32.58 
 
 
265 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  34.13 
 
 
263 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.73 
 
 
263 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  34.13 
 
 
263 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
263 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  33.73 
 
 
263 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  33.73 
 
 
263 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  34.13 
 
 
263 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  33.73 
 
 
263 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  32.83 
 
 
283 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  33.73 
 
 
263 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  34.13 
 
 
263 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  33.73 
 
 
263 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  34.13 
 
 
263 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  33.59 
 
 
278 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  33.73 
 
 
263 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
260 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  35.97 
 
 
267 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
246 aa  143  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  32.79 
 
 
246 aa  143  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
284 aa  142  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
291 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 
263 aa  142  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  35.54 
 
 
242 aa  141  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  34.13 
 
 
290 aa  141  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  35.43 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  35.43 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  34.92 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  34.8 
 
 
267 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  35.32 
 
 
308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  36.84 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
550 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  36.43 
 
 
267 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  35.91 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  36.19 
 
 
277 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
260 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
269 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  32.94 
 
 
267 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
257 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  36.82 
 
 
248 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  35.45 
 
 
256 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  31.76 
 
 
266 aa  135  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  33.92 
 
 
267 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>