More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_1180 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
267 aa  541  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  48.86 
 
 
262 aa  255  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  48.41 
 
 
255 aa  228  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  42.23 
 
 
260 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  42.63 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  41.83 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  39.84 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  41.43 
 
 
260 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
268 aa  195  8.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
260 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  43.53 
 
 
259 aa  192  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  41.04 
 
 
260 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  40.8 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  42.21 
 
 
272 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  39.44 
 
 
252 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  38.74 
 
 
256 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  38.13 
 
 
277 aa  186  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
254 aa  182  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  40.61 
 
 
260 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  38.8 
 
 
252 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  37.89 
 
 
261 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  38.74 
 
 
252 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  39.53 
 
 
256 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  39.6 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  38.02 
 
 
265 aa  168  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  39.57 
 
 
273 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  40.59 
 
 
265 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  37.2 
 
 
295 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  40.87 
 
 
290 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  35.2 
 
 
264 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  33.98 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  37.94 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  39.15 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  41.52 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  37.15 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  35.36 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  38.65 
 
 
265 aa  162  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  39.61 
 
 
259 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  35.84 
 
 
257 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
260 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  35.5 
 
 
280 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  39.26 
 
 
254 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
269 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  39.48 
 
 
308 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  42.48 
 
 
256 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
273 aa  158  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
257 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  36.65 
 
 
280 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  37.05 
 
 
277 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  36.65 
 
 
280 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  36.65 
 
 
280 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
267 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  37.01 
 
 
265 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  38.22 
 
 
257 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  38.46 
 
 
248 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  34.13 
 
 
267 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  34.62 
 
 
280 aa  155  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  34.9 
 
 
271 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  37.2 
 
 
279 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
259 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.97 
 
 
263 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  35.97 
 
 
263 aa  155  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  35.97 
 
 
263 aa  155  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  35.97 
 
 
263 aa  155  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
263 aa  155  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  35.97 
 
 
263 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  35.97 
 
 
263 aa  155  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  34.51 
 
 
271 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  34.51 
 
 
271 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  35.97 
 
 
263 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  35.97 
 
 
263 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  34.51 
 
 
271 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  34.51 
 
 
271 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  34.51 
 
 
256 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  35.97 
 
 
263 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  35.97 
 
 
263 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  34.51 
 
 
256 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  37.05 
 
 
277 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  34.51 
 
 
271 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  34.51 
 
 
271 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  35.97 
 
 
263 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  35.97 
 
 
263 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  42.17 
 
 
258 aa  153  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  37.05 
 
 
276 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
282 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  37.28 
 
 
255 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  34.66 
 
 
274 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  34.66 
 
 
274 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  34.66 
 
 
274 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
283 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  34.66 
 
 
274 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  35.77 
 
 
276 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  34.66 
 
 
274 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  35.18 
 
 
263 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  34.66 
 
 
274 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  35.06 
 
 
275 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  34.66 
 
 
274 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>