More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2031 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
273 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  55.47 
 
 
262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1365  transcriptional regulator, IclR family  55.7 
 
 
259 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.490803  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1668  transcriptional regulator, IclR family  55.7 
 
 
259 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.145248  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  47.19 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  46.12 
 
 
277 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  46.64 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  45.74 
 
 
268 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
263 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
268 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  47.56 
 
 
257 aa  198  6e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  47.77 
 
 
269 aa  198  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  46.18 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  46.18 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  47.77 
 
 
270 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  47.77 
 
 
270 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  45.35 
 
 
270 aa  196  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  45.35 
 
 
270 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  47.77 
 
 
270 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  47.77 
 
 
270 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
269 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
269 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
269 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  47.77 
 
 
270 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  47.77 
 
 
270 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
269 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
269 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  47.77 
 
 
270 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  47.77 
 
 
270 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  45.28 
 
 
266 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  44.7 
 
 
262 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  45.49 
 
 
286 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  45.49 
 
 
261 aa  191  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  44.67 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  44.67 
 
 
256 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  42.31 
 
 
242 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  44.08 
 
 
259 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  42.97 
 
 
257 aa  185  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
274 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2376  transcriptional regulator, IclR family  42.21 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157038  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  43.95 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.26 
 
 
259 aa  145  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  34.68 
 
 
254 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.6 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  36.19 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 
257 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
268 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  34 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  34.23 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  33.84 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  36.61 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
272 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
254 aa  131  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  38.7 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
250 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 
250 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
256 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
250 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 
250 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
250 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  35.06 
 
 
269 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 
250 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
250 aa  126  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  36.57 
 
 
249 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
260 aa  125  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 
257 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  37.37 
 
 
265 aa  125  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  37.07 
 
 
276 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  33.64 
 
 
258 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  31.91 
 
 
280 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
317 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.62 
 
 
260 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  29.84 
 
 
260 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 
257 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  36.36 
 
 
272 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 
248 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
258 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
250 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3415  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 
330 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257423  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
275 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
269 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
250 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  31.5 
 
 
277 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
276 aa  123  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  35.86 
 
 
266 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  35.86 
 
 
266 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  30.71 
 
 
255 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  31.1 
 
 
276 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2768  IclR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
299 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
260 aa  122  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0542  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
290 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  37.17 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
299 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  33.21 
 
 
284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  31.33 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>