More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2257 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
259 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  58.9 
 
 
257 aa  249  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  54.29 
 
 
276 aa  241  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  54.32 
 
 
265 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  52.46 
 
 
248 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  56.16 
 
 
256 aa  235  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  54.87 
 
 
258 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  53.16 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  55.91 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  46.91 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  48.64 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  46.72 
 
 
260 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  45.71 
 
 
257 aa  202  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  48.55 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  51.09 
 
 
283 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  47.25 
 
 
249 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  46.12 
 
 
264 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  39.61 
 
 
267 aa  162  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
268 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  40.94 
 
 
256 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
273 aa  155  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  38.74 
 
 
255 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  43.19 
 
 
290 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  40.36 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  36.68 
 
 
252 aa  146  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  34.94 
 
 
261 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.53 
 
 
256 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
272 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  35.46 
 
 
257 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  33.05 
 
 
257 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  39.61 
 
 
276 aa  137  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
263 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  35.46 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  32.79 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  32.39 
 
 
271 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 
271 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  32.39 
 
 
271 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  32.39 
 
 
271 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  32.39 
 
 
271 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  32.39 
 
 
271 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.98 
 
 
256 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.98 
 
 
256 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.26 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  38.29 
 
 
277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  38.17 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  38 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  36.77 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  35.57 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  31.23 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  35.66 
 
 
265 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  33.47 
 
 
280 aa  129  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  35.66 
 
 
265 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
263 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  36.28 
 
 
254 aa  129  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  38.96 
 
 
267 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  36.16 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  36.16 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  33.87 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  36.16 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  34.13 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  36.16 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  36.16 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  35.66 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  33.87 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  36 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  35.14 
 
 
254 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  29.48 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  35.71 
 
 
274 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 
274 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  35.71 
 
 
274 aa  125  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  35.71 
 
 
274 aa  125  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  35.71 
 
 
274 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  34.38 
 
 
276 aa  125  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  35.71 
 
 
274 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  38.43 
 
 
248 aa  125  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  35.71 
 
 
274 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  37.17 
 
 
277 aa  125  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  35.71 
 
 
274 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  36.8 
 
 
281 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  40.91 
 
 
267 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
261 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  33.73 
 
 
263 aa  125  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  36.16 
 
 
277 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
262 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
263 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
284 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  34.96 
 
 
252 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.32 
 
 
263 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  36.32 
 
 
263 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
263 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  36.32 
 
 
263 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  36.32 
 
 
263 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  36.32 
 
 
263 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  36.32 
 
 
263 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  37.9 
 
 
262 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>