More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2503 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  99.62 
 
 
262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  99.62 
 
 
262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  100 
 
 
262 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  72.11 
 
 
267 aa  346  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  54.44 
 
 
266 aa  255  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  54.44 
 
 
266 aa  255  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  50.6 
 
 
263 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  48.59 
 
 
277 aa  225  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  45.42 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
269 aa  193  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
260 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  48.46 
 
 
272 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  42.91 
 
 
261 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  43.23 
 
 
266 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
261 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
260 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 
260 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
262 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
260 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 
260 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
260 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  35.66 
 
 
260 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
276 aa  142  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  36.36 
 
 
254 aa  141  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  39.11 
 
 
281 aa  141  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  35.66 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  31.35 
 
 
255 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  34.77 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
265 aa  138  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 
275 aa  138  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
272 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  36.69 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  35.22 
 
 
259 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  35.86 
 
 
277 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  35.63 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  35.22 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  34.11 
 
 
267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  36.72 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  36.4 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 
257 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  32.67 
 
 
265 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.68 
 
 
261 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.53 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  37.55 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  37.75 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  32.39 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
267 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  36.02 
 
 
290 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  33.59 
 
 
263 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
259 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  35.68 
 
 
308 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  35.48 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  32.81 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  39.17 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  34.27 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 
252 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  32.42 
 
 
263 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  32.28 
 
 
263 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
263 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
259 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
278 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
282 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
263 aa  118  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  32.94 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  32.94 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  34 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  34 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  34 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2854  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
285 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
261 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  34.51 
 
 
293 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 
278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  33.99 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  36.11 
 
 
249 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  33.6 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  31.3 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  34.52 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  31.05 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  32.94 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
275 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  27.59 
 
 
264 aa  113  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
283 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.93 
 
 
258 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  32.68 
 
 
280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>