More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4506 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 275 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 275 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  81.82 
 
 		 274 aa  411  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  78.36 
 
 		 285 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  70.45 
 
 		 278 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  70.34 
 
 		 278 aa  363  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  63.42 
 
 		 295 aa  336  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  56.81 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  56.03 
 
 		 294 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  57.2 
 
 		 286 aa  278  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  57.87 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  58.27 
 
 		 324 aa  275  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  55.12 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 285 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 285 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 285 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 316 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 316 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 316 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  53.46 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 316 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 285 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 316 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 316 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  54.15 
 
 		 285 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 284 aa  265  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 297 aa  262  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 298 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 298 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 285 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 298 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 314 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 314 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 310 aa  260  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 279 aa  234  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 268 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3600  regulatory protein, IclR  35.79 
 
 		 278 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  39.46 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  33.47 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  33.92 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  33.47 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 291 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  33.71 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  36.24 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  33.04 
 
 		 291 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 267 aa  126  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  33.04 
 
 		 291 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 275 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  33.05 
 
 		 267 aa  122  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 267 aa  122  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  31.27 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01930  transcriptional regulator PcaR  33.04 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.676687 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0233  transcriptional regulator PcaR  33.04 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 254 aa  119  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  32.81 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  32.53 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  32.94 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  29.72 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  32.94 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  35.63 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 280 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 275 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>