More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3360 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
261 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  96.56 
 
 
262 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  96.18 
 
 
275 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  95.04 
 
 
275 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  95.04 
 
 
275 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  95.04 
 
 
275 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  95.42 
 
 
275 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  88.89 
 
 
261 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  88.51 
 
 
261 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  88.51 
 
 
261 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  88.89 
 
 
261 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  88.51 
 
 
285 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  88.51 
 
 
285 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  88.51 
 
 
285 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  85.71 
 
 
274 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  85.43 
 
 
274 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  84.65 
 
 
274 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  73.62 
 
 
278 aa  377  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  73.71 
 
 
263 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  69.85 
 
 
275 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  70.87 
 
 
303 aa  367  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  69.29 
 
 
319 aa  354  7.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  68.02 
 
 
278 aa  340  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  64.94 
 
 
267 aa  328  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  61.54 
 
 
267 aa  326  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  61.15 
 
 
267 aa  325  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  63.45 
 
 
261 aa  319  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  60.23 
 
 
267 aa  315  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  62 
 
 
294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  56.33 
 
 
267 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  53.06 
 
 
267 aa  261  6e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  53.31 
 
 
258 aa  259  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  54.37 
 
 
261 aa  259  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  54.27 
 
 
264 aa  255  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  52.87 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  52.42 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  50.41 
 
 
267 aa  245  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  50.39 
 
 
269 aa  244  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  54.58 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  53.48 
 
 
263 aa  239  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  49.8 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4070  IclR family transcriptional regulator  54.08 
 
 
274 aa  229  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  48.18 
 
 
252 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  49.57 
 
 
268 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  48.77 
 
 
601 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  46.96 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  44.35 
 
 
291 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  44.35 
 
 
291 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  44.35 
 
 
291 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
291 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  50.23 
 
 
256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  43.95 
 
 
279 aa  214  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  50.47 
 
 
256 aa  214  9e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  43.32 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  43.32 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  43.72 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  44.57 
 
 
263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5019  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  46.75 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563485  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3996  IclR family transcriptional regulator  43.03 
 
 
256 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  40.07 
 
 
284 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  42.29 
 
 
277 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  43.27 
 
 
266 aa  205  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  43.75 
 
 
254 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3721  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  45.69 
 
 
251 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  45.42 
 
 
268 aa  202  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
295 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0233  transcriptional regulator PcaR  43.72 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3045  transcriptional regulator IclR  42.52 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01930  transcriptional regulator PcaR  43.32 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.676687 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5091  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  44.83 
 
 
269 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  42.8 
 
 
263 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0440  IclR family transcriptional regulator  43.03 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  39.76 
 
 
282 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
288 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  43.46 
 
 
273 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  38.55 
 
 
298 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
277 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4893  transcriptional regulator, IclR family  41.37 
 
 
549 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02912  transcriptional regulator  44.39 
 
 
223 aa  183  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4439  IclR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325495  normal  0.819621 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
265 aa  181  9.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4269  IclR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
256 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0275811  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1629  IclR family transcriptional regulator  39.17 
 
 
256 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5965  IclR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
257 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4339  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  40.91 
 
 
260 aa  175  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3977  IclR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
257 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4390  IclR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
257 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4232  IclR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190014  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3802  IclR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1220  IclR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
294 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2154  IclR family transcriptional regulator  38.56 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1079  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
256 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.160776  normal  0.539757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1846  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
263 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762112  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
325 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0267  IclR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
250 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000958449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3689  transcriptional regulator, IclR family  35.37 
 
 
250 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000176782  hitchhiker  0.0000000000718636 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5034  regulatory protein, IclR  34.85 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3330  transcriptional regulator, IclR family  34.69 
 
 
264 aa  165  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1648  regulatory proteins, IclR  34.29 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3216  IclR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>