More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4232 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4232  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190014  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1629  IclR family transcriptional regulator  97.27 
 
 
256 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3977  IclR family transcriptional regulator  96.08 
 
 
257 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4390  IclR family transcriptional regulator  96.08 
 
 
257 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5965  IclR family transcriptional regulator  95.69 
 
 
257 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4269  IclR family transcriptional regulator  94.53 
 
 
256 aa  487  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0275811  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3802  IclR family transcriptional regulator  94.53 
 
 
256 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1220  IclR family transcriptional regulator  87.5 
 
 
294 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1079  IclR family transcriptional regulator  78.91 
 
 
256 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.160776  normal  0.539757 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5034  regulatory protein, IclR  66.8 
 
 
255 aa  354  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4304  transcriptional regulator, IclR family  66.02 
 
 
255 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4414  transcriptional regulator, IclR family  66.02 
 
 
255 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0267  IclR family transcriptional regulator  57.77 
 
 
250 aa  295  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000958449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3689  transcriptional regulator, IclR family  57.37 
 
 
250 aa  291  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000176782  hitchhiker  0.0000000000718636 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1648  regulatory proteins, IclR  59.29 
 
 
270 aa  291  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3330  transcriptional regulator, IclR family  57.77 
 
 
264 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1846  IclR family transcriptional regulator  57.37 
 
 
263 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762112  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4439  IclR family transcriptional regulator  55.78 
 
 
256 aa  277  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325495  normal  0.819621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3684  IclR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  43.6 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  44.54 
 
 
267 aa  201  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1436  IclR family transcriptional regulator  45.02 
 
 
281 aa  198  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.580243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  45.91 
 
 
263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0440  IclR family transcriptional regulator  43.93 
 
 
267 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5019  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  43.03 
 
 
252 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563485  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  42.44 
 
 
264 aa  188  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
261 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  44.02 
 
 
256 aa  184  9e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  44.02 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  41.56 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3721  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  40.96 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  41.56 
 
 
252 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2383  transcriptional regulator, IclR family  43.03 
 
 
256 aa  178  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
267 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  40.68 
 
 
267 aa  175  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4359  IclR family transcriptional regulator  43.31 
 
 
260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.274629  normal  0.552414 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  38.49 
 
 
262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  37.66 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  37.66 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
285 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
285 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5091  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  42.68 
 
 
269 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  42.53 
 
 
268 aa  172  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  37.24 
 
 
261 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  37.24 
 
 
261 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2991  IclR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
280 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  38.49 
 
 
267 aa  169  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
275 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  38.49 
 
 
267 aa  168  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
275 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
275 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
275 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  37.76 
 
 
258 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
274 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  37.8 
 
 
274 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
277 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  41.25 
 
 
273 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  39.75 
 
 
268 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
285 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
274 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  41.18 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  42.08 
 
 
601 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2154  IclR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1902  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  41.96 
 
 
273 aa  162  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.924992  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  37.7 
 
 
266 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
291 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2753  IclR family transcriptional regulator  39.59 
 
 
244 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
291 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  38.67 
 
 
269 aa  158  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3045  transcriptional regulator IclR  33.61 
 
 
266 aa  158  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4070  IclR family transcriptional regulator  41.01 
 
 
274 aa  158  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  37.34 
 
 
261 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20200  transcriptional regulator, IclR family  36.33 
 
 
255 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
267 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
294 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  36.21 
 
 
298 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  36.71 
 
 
291 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  36.71 
 
 
291 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2609  IclR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  0.0160268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3216  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  35.83 
 
 
303 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  34.98 
 
 
282 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
325 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
280 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3116  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  35.55 
 
 
256 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
263 aa  152  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  35.86 
 
 
280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
265 aa  152  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  35.86 
 
 
280 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  34.82 
 
 
284 aa  151  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
319 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
267 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  35.83 
 
 
263 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4893  transcriptional regulator, IclR family  40.25 
 
 
549 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  34.18 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3996  IclR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
256 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>