More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1265 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 280 aa  569  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  89.96 
 
 		 280 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  89.61 
 
 		 280 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  84.89 
 
 		 291 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  85.09 
 
 		 291 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  85.09 
 
 		 291 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  87.17 
 
 		 291 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  81.09 
 
 		 279 aa  467  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0233  transcriptional regulator PcaR  80 
 
 		 281 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01930  transcriptional regulator PcaR  80.3 
 
 		 279 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.676687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  53.2 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  51.85 
 
 		 267 aa  256  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  49 
 
 		 261 aa  246  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4339  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  53.97 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  47.27 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  46.77 
 
 		 282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  48.37 
 
 		 267 aa  231  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  47.79 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  47.39 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  47.76 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  47.33 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  53.15 
 
 		 249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  50.87 
 
 		 267 aa  221  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  43.5 
 
 		 263 aa  221  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3721  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  48.56 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  48.77 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  47.44 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  42.68 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  47.44 
 
 		 252 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 262 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 267 aa  218  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  44.08 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 275 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 274 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 275 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 275 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  42.37 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  41.46 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 261 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 285 aa  211  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02912  transcriptional regulator  52.91 
 
 		 223 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  43.97 
 
 		 261 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  43.97 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  43.97 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  43.97 
 
 		 261 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  42.26 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  43.78 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  40.24 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  41.3 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4070  IclR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 274 aa  205  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5019  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  42.39 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563485  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  46.67 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 267 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  42.8 
 
 		 267 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 264 aa  195  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4893  transcriptional regulator, IclR family  42.34 
 
 		 549 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0440  IclR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 267 aa  189  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  39.32 
 
 		 263 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 601 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  46.58 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3045  transcriptional regulator IclR  41.1 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5091  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  43.32 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  44.49 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  40.7 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2753  IclR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3996  IclR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2154  IclR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2609  IclR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  0.0160268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3216  IclR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  38.11 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3116  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  37.66 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20200  transcriptional regulator, IclR family  36.82 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5034  regulatory protein, IclR  37.95 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3689  transcriptional regulator, IclR family  36.82 
 
 		 250 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000176782  hitchhiker  0.0000000000718636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2383  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5965  IclR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0267  IclR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000958449 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4269  IclR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0275811  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1629  IclR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3977  IclR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259403  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1436  IclR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 281 aa  155  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.580243 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3802  IclR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4390  IclR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  37.1 
 
 		 268 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4232  IclR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>