More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2067 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  98.86 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  92.28 
 
 		 275 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  75.69 
 
 		 319 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  74.22 
 
 		 303 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  76.77 
 
 		 274 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  70.7 
 
 		 275 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  73.62 
 
 		 261 aa  377  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  70.33 
 
 		 275 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  70.33 
 
 		 275 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  73.52 
 
 		 262 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  69.34 
 
 		 275 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  70.33 
 
 		 275 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  72.31 
 
 		 274 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  71.65 
 
 		 274 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  73.52 
 
 		 285 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  73.12 
 
 		 285 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  73.12 
 
 		 261 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  73.12 
 
 		 285 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  73.12 
 
 		 261 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  73.12 
 
 		 261 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  73.12 
 
 		 261 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  68.7 
 
 		 278 aa  344  8e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  65.61 
 
 		 267 aa  332  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  65.46 
 
 		 261 aa  328  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  64.31 
 
 		 267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  64.31 
 
 		 267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  59.47 
 
 		 267 aa  310  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  62.11 
 
 		 294 aa  305  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  53.09 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  54.36 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  56.96 
 
 		 267 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  51.76 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  49.39 
 
 		 267 aa  237  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  51.01 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 601 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  48.44 
 
 		 269 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  48.68 
 
 		 263 aa  222  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 280 aa  219  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  44.03 
 
 		 279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  53.46 
 
 		 268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  41.56 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  41.56 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0233  transcriptional regulator PcaR  43.27 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  43.5 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  41.49 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  41.49 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4070  IclR family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 274 aa  206  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3996  IclR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 256 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 291 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  42.97 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  42.97 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01930  transcriptional regulator PcaR  42.04 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.676687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  42.57 
 
 		 254 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5019  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  42.68 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  42.51 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  46.03 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 263 aa  199  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3721  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  43.04 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  45.22 
 
 		 268 aa  198  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  43.72 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  41 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  39.84 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02912  transcriptional regulator  46.4 
 
 		 223 aa  192  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  38.21 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3045  transcriptional regulator IclR  41 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 277 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 288 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5091  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  43.04 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  42.26 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4893  transcriptional regulator, IclR family  43.8 
 
 		 549 aa  185  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  44.3 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0440  IclR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4339  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  41.56 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 265 aa  175  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 		 325 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 271 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  33.59 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2753  IclR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 244 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  40.39 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  34.19 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5034  regulatory protein, IclR  34.03 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5965  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7060  IclR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.579294  normal  0.280018 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4269  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0275811  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3977  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>