More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5569 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  80.26 
 
 		 303 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  75.29 
 
 		 275 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  75.29 
 
 		 263 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  75.69 
 
 		 278 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  69.52 
 
 		 274 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  71.94 
 
 		 261 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  71.94 
 
 		 261 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  71.94 
 
 		 261 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  71.94 
 
 		 261 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  68 
 
 		 274 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  71.94 
 
 		 285 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  71.94 
 
 		 285 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  68 
 
 		 274 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 275 aa  362  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  69.96 
 
 		 262 aa  361  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  71.54 
 
 		 285 aa  361  9e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  69.96 
 
 		 275 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  69.96 
 
 		 275 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  69.96 
 
 		 275 aa  358  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  69.96 
 
 		 275 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  69.29 
 
 		 261 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  63.6 
 
 		 278 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  65.61 
 
 		 267 aa  338  5e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  65.46 
 
 		 261 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  62.55 
 
 		 267 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  62.55 
 
 		 267 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  62.85 
 
 		 267 aa  318  6e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 294 aa  309  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  56.56 
 
 		 258 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 261 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  53.11 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  53.85 
 
 		 267 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  50.19 
 
 		 264 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  49.8 
 
 		 267 aa  245  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  51.45 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  51.24 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  51.87 
 
 		 601 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  49.56 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  48.03 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  53.91 
 
 		 268 aa  228  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0233  transcriptional regulator PcaR  47.13 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  43.5 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  49.79 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  49.79 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01930  transcriptional regulator PcaR  45.9 
 
 		 279 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.676687 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  50.65 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  41.56 
 
 		 280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  42.34 
 
 		 291 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  45.53 
 
 		 256 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 291 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  42.34 
 
 		 291 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 263 aa  212  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4070  IclR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 274 aa  212  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 277 aa  212  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  41.15 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3721  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  45.93 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  45.53 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5019  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  46.06 
 
 		 252 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3996  IclR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 256 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  46.91 
 
 		 268 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  42.4 
 
 		 254 aa  203  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5091  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  47.84 
 
 		 269 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4339  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  45.56 
 
 		 260 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3045  transcriptional regulator IclR  42.8 
 
 		 266 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  40.32 
 
 		 284 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  42.57 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  44.54 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  39.43 
 
 		 282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  37.79 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0440  IclR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 267 aa  188  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02912  transcriptional regulator  47.3 
 
 		 223 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4893  transcriptional regulator, IclR family  42.91 
 
 		 549 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  42.68 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 288 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3689  transcriptional regulator, IclR family  37.8 
 
 		 250 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000176782  hitchhiker  0.0000000000718636 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  42.17 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0267  IclR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000958449 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6477  regulatory protein, IclR  35.56 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2753  IclR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20200  transcriptional regulator, IclR family  37.3 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1648  regulatory proteins, IclR  34.56 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3216  IclR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7060  IclR family transcriptional regulator  37 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.579294  normal  0.280018 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 274 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2609  IclR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  0.0160268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3116  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  36.73 
 
 		 256 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3330  transcriptional regulator, IclR family  34.55 
 
 		 264 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 263 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 263 aa  158  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2154  IclR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.935715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>