More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2287 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 267 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  68.63 
 
 		 264 aa  331  8e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  69.69 
 
 		 261 aa  329  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  67.47 
 
 		 267 aa  308  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  63.08 
 
 		 263 aa  293  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  62.75 
 
 		 249 aa  279  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  55.56 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4893  transcriptional regulator, IclR family  58.96 
 
 		 549 aa  255  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  52.42 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  52.26 
 
 		 303 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  60.91 
 
 		 269 aa  251  6e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  61.64 
 
 		 268 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  55.29 
 
 		 601 aa  250  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 285 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 285 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  52.17 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  52.17 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  51.78 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  51.78 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  51.78 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  53.53 
 
 		 294 aa  244  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  51.76 
 
 		 278 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  52.16 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4070  IclR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  53.28 
 
 		 267 aa  242  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 		 275 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 267 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  52.67 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  48.58 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  49.16 
 
 		 267 aa  238  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 267 aa  238  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  50.21 
 
 		 291 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  53.16 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  49.59 
 
 		 278 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 274 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  48.24 
 
 		 258 aa  234  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  49.58 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  49.58 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  49.58 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 280 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  47.56 
 
 		 280 aa  231  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  47.15 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  48.81 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  47.77 
 
 		 279 aa  228  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  48.95 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0440  IclR family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 267 aa  222  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0233  transcriptional regulator PcaR  49.8 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01930  transcriptional regulator PcaR  49.8 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.676687 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 265 aa  219  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  47.7 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  51.19 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  46.5 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  46.5 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  45.38 
 
 		 268 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  43.53 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  43.53 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5019  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  45.99 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4269  IclR family transcriptional regulator  44.73 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0275811  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4232  IclR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 256 aa  201  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  49.58 
 
 		 273 aa  201  9e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  45.16 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  46.12 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3802  IclR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5965  IclR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 295 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3977  IclR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 257 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4390  IclR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 257 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3721  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  42.52 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3045  transcriptional regulator IclR  44.21 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4339  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  47.44 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1629  IclR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  48.9 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  42.98 
 
 		 282 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  43.39 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3216  IclR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2154  IclR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2609  IclR family transcriptional regulator  41 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  0.0160268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5034  regulatory protein, IclR  39.6 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3116  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  41.42 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1079  IclR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.160776  normal  0.539757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1220  IclR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1648  regulatory proteins, IclR  43.04 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4439  IclR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325495  normal  0.819621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3330  transcriptional regulator, IclR family  40.93 
 
 		 264 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 288 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1846  IclR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 263 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762112  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02912  transcriptional regulator  49.54 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5091  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  43.67 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  48.21 
 
 		 281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>