More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1079 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1079  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.160776  normal  0.539757 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4232  IclR family transcriptional regulator  78.91 
 
 		 256 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1629  IclR family transcriptional regulator  78.12 
 
 		 256 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4269  IclR family transcriptional regulator  78.12 
 
 		 256 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0275811  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1220  IclR family transcriptional regulator  77.73 
 
 		 294 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3977  IclR family transcriptional regulator  77.65 
 
 		 257 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259403  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3802  IclR family transcriptional regulator  77.34 
 
 		 256 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4390  IclR family transcriptional regulator  77.65 
 
 		 257 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5965  IclR family transcriptional regulator  77.25 
 
 		 257 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4304  transcriptional regulator, IclR family  67.19 
 
 		 255 aa  361  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4414  transcriptional regulator, IclR family  67.19 
 
 		 255 aa  361  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5034  regulatory protein, IclR  66.02 
 
 		 255 aa  358  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3330  transcriptional regulator, IclR family  55.38 
 
 		 264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0267  IclR family transcriptional regulator  53.78 
 
 		 250 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000958449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3689  transcriptional regulator, IclR family  53.78 
 
 		 250 aa  280  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000176782  hitchhiker  0.0000000000718636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1846  IclR family transcriptional regulator  54.58 
 
 		 263 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762112  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1648  regulatory proteins, IclR  54.98 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4439  IclR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325495  normal  0.819621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3684  IclR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 254 aa  234  8e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  43.62 
 
 		 267 aa  209  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1436  IclR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.580243 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5019  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  44.35 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2383  transcriptional regulator, IclR family  44.67 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  42.34 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  40.76 
 
 		 264 aa  185  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  41.2 
 
 		 256 aa  185  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  41.33 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  41.2 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0440  IclR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  42.47 
 
 		 252 aa  178  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  42.47 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3721  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  39.27 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  39.91 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  36.82 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  36.82 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4359  IclR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.274629  normal  0.552414 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  36.82 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  36.82 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5091  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  41.74 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2991  IclR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1902  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  41.92 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.924992  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  41.1 
 
 		 268 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  41.59 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2154  IclR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 256 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  36.82 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 274 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  37.92 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2609  IclR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  0.0160268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3216  IclR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3116  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  35.94 
 
 		 256 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  38.5 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 325 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  38.22 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  34.98 
 
 		 258 aa  158  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20200  transcriptional regulator, IclR family  34.77 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2753  IclR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  37.08 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  36.05 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  36.84 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 601 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  36.28 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  34.58 
 
 		 303 aa  151  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4070  IclR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3045  transcriptional regulator IclR  34.63 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  35.66 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  34.69 
 
 		 263 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  33.05 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  34.31 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 264 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  32.22 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4339  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  36.67 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  32.64 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  34.08 
 
 		 280 aa  141  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 265 aa  141  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02912  transcriptional regulator  40.47 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  34.22 
 
 		 291 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  33.63 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>