More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2174 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 274 aa  559  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  95.99 
 
 		 274 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  86.5 
 
 		 274 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  83.52 
 
 		 275 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  85.83 
 
 		 275 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  83.52 
 
 		 262 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  85.43 
 
 		 261 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  85.83 
 
 		 275 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  85.83 
 
 		 275 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  83.14 
 
 		 275 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  82.51 
 
 		 285 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  82.51 
 
 		 285 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  80.81 
 
 		 285 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  84.65 
 
 		 261 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  84.65 
 
 		 261 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  84.65 
 
 		 261 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  84.65 
 
 		 261 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  72.03 
 
 		 263 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  71.65 
 
 		 278 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  71.48 
 
 		 303 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  70.87 
 
 		 275 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  70.98 
 
 		 319 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  66.02 
 
 		 278 aa  344  8e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  64.12 
 
 		 267 aa  335  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  64.86 
 
 		 261 aa  335  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  64.82 
 
 		 267 aa  330  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  64.82 
 
 		 267 aa  329  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  63.53 
 
 		 267 aa  328  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  62.4 
 
 		 294 aa  319  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  51.29 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  53.72 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  55.13 
 
 		 267 aa  251  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  52.99 
 
 		 264 aa  251  8.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  53.69 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  52.91 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 267 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  52.74 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 264 aa  235  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  52.72 
 
 		 268 aa  231  9e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  47.83 
 
 		 269 aa  229  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 		 601 aa  226  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  45.35 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4070  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 280 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  48.7 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5019  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  47.44 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  46.77 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  42.21 
 
 		 280 aa  208  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  44.05 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  46.59 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  44.05 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  41.83 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  43.85 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3996  IclR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  41.2 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  44.58 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  42.19 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  44.18 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  46.98 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01930  transcriptional regulator PcaR  43.94 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.676687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3045  transcriptional regulator IclR  45.04 
 
 		 266 aa  198  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  44.62 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0233  transcriptional regulator PcaR  43.94 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3721  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  46.12 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5091  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  45.22 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4893  transcriptional regulator, IclR family  41.37 
 
 		 549 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02912  transcriptional regulator  46.64 
 
 		 223 aa  188  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  40.83 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  39.76 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  37.75 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0440  IclR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 277 aa  181  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4339  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  41.57 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 325 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1220  IclR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0267  IclR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 250 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000958449 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4269  IclR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 256 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0275811  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5965  IclR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3977  IclR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4390  IclR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1648  regulatory proteins, IclR  35.63 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1629  IclR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5034  regulatory protein, IclR  35.27 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3689  transcriptional regulator, IclR family  36.59 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000176782  hitchhiker  0.0000000000718636 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3802  IclR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4232  IclR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1079  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.160776  normal  0.539757 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4304  transcriptional regulator, IclR family  35.12 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4414  transcriptional regulator, IclR family  35.12 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4439  IclR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325495  normal  0.819621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1846  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762112  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  40.8 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>