More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5091 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5091  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  100 
 
 		 269 aa  538  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5019  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  66 
 
 		 252 aa  322  3e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  58.33 
 
 		 268 aa  298  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  60 
 
 		 252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  60.4 
 
 		 252 aa  288  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  56.8 
 
 		 256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  56 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3721  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  55.6 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  52.87 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  48.71 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  47.3 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 262 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4339  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  48.99 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0440  IclR family transcriptional regulator  45 
 
 		 267 aa  209  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  46.89 
 
 		 264 aa  208  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 261 aa  208  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  43.6 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 274 aa  205  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  44.35 
 
 		 261 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  44.35 
 
 		 261 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  44.35 
 
 		 261 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  44.35 
 
 		 261 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 285 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 285 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  44.78 
 
 		 274 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  43.04 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 280 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  43.48 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  44.35 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  42.91 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  42.91 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  42.61 
 
 		 275 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  43.67 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 277 aa  192  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  42.51 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  45.45 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  45.37 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1220  IclR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  40.91 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  46.73 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5965  IclR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  44.93 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  45.58 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 601 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  40.73 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  40.73 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3977  IclR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4390  IclR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4232  IclR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 256 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1079  IclR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.160776  normal  0.539757 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5034  regulatory protein, IclR  39.82 
 
 		 255 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1629  IclR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  41.02 
 
 		 263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4269  IclR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0275811  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  41.94 
 
 		 249 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2154  IclR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3802  IclR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01930  transcriptional regulator PcaR  42.8 
 
 		 279 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.676687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0233  transcriptional regulator PcaR  42.39 
 
 		 281 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  40.24 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4304  transcriptional regulator, IclR family  37.14 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4414  transcriptional regulator, IclR family  37.14 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0267  IclR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000958449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2753  IclR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2609  IclR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  0.0160268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3689  transcriptional regulator, IclR family  40.73 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000176782  hitchhiker  0.0000000000718636 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3045  transcriptional regulator IclR  39.43 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3216  IclR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3116  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  38.19 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3330  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  39.66 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 265 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  40 
 
 		 298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4070  IclR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 274 aa  165  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4893  transcriptional regulator, IclR family  42.24 
 
 		 549 aa  165  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3684  IclR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  41.46 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1648  regulatory proteins, IclR  38.55 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4439  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325495  normal  0.819621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>