More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2912 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 266 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 266 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 263 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  56.5 
 
 		 277 aa  268  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  54.44 
 
 		 262 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 262 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  54.44 
 
 		 262 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  52.44 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  51.2 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  47.13 
 
 		 269 aa  232  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 269 aa  231  8.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  48.98 
 
 		 261 aa  208  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  48.98 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  34.68 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  36.29 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  38.7 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  36.29 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  38.55 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.13 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  35.89 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  35.48 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 260 aa  152  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  34.26 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.39 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  35.57 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 252 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  35.48 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  34.01 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  32.39 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  36.84 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  32.92 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  34.12 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3937  transcriptional regulator, IclR family  35.91 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  34.69 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  35.24 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  31.69 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  39.57 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 		 263 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  32.27 
 
 		 267 aa  125  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  30.49 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  30.49 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  30.49 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  30.49 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  34.75 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 255 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  34.5 
 
 		 255 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 255 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 255 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  36.14 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  36.17 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2854  transcriptional regulator, IclR family  34.43 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  33.73 
 
 		 267 aa  119  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  38.07 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  31.17 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  31.85 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  31.17 
 
 		 263 aa  118  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 283 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 263 aa  118  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 259 aa  118  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  30.4 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>