More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4095 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 269 aa  537  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  61.57 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  50.56 
 
 		 273 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  49.58 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  36.47 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  37.95 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  33.76 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  37.55 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  38.33 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  30.52 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  32.91 
 
 		 260 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  35.86 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  35.86 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 262 aa  128  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.06 
 
 		 259 aa  128  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  35.09 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  31.42 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  31.91 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.11 
 
 		 257 aa  122  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.49 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  33 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  29.18 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  31.73 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  32.93 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 257 aa  119  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  32.76 
 
 		 255 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4172  transcriptional regulator, IclR family  38.92 
 
 		 249 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  30.15 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  38.03 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  32.37 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.89 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  28.76 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  29.61 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  34.66 
 
 		 267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7484  IclR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 261 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  36.17 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  32.56 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  31 
 
 		 263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  30.04 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  31.76 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  32.68 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  32.68 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4434  transcriptional regulator, IclR family  34.8 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0001758  normal  0.639145 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.63 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.63 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.63 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  33.8 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.63 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  30.13 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 		 269 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  35.09 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  33.49 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  31.25 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  29.49 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  34.19 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  28.23 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  27.38 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>