More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3102 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 260 aa  533  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  82.69 
 
 		 260 aa  454  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  82.69 
 
 		 260 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  80.38 
 
 		 260 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  80 
 
 		 260 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  78.85 
 
 		 260 aa  434  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  79.23 
 
 		 260 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  73.95 
 
 		 261 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  67.44 
 
 		 265 aa  374  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  67.18 
 
 		 265 aa  352  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  63.2 
 
 		 257 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  53.85 
 
 		 263 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 259 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  53.85 
 
 		 257 aa  265  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  51.55 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  41.04 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  38.91 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  38.34 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  38.31 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  39.76 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  37.15 
 
 		 259 aa  188  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  35.66 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  38.13 
 
 		 280 aa  185  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  37.55 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  39.06 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  36.8 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  35.29 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  36.32 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.86 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  35.86 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  35.86 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  35.86 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  35.86 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  35.86 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  35.86 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  36.44 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  36.11 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  36.44 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  36.44 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  36.44 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  36.44 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  36.44 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  39.73 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  32.53 
 
 		 277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  36.32 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  34.94 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  37.44 
 
 		 308 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  34.54 
 
 		 252 aa  161  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  33.33 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  35.47 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  32.66 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  35.63 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  34.62 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 267 aa  151  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  32.4 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  34.26 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  34.26 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  34.26 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  33.76 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  33.76 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  33.59 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  35.2 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1395  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000767969  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  31.37 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  32.34 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  32.8 
 
 		 265 aa  142  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 283 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 280 aa  141  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  35.66 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  35.51 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  32.59 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  35.66 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.8 
 
 		 278 aa  139  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>