More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1395 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1395  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 258 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000767969  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  57.03 
 
 		 254 aa  290  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  55.08 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 256 aa  288  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 258 aa  259  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1371  transcriptional regulator, IclR family  49.02 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000320522 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3286  IclR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2842  transcriptional regulator, IclR family  45.67 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.50092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  32.3 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  32.56 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  32.68 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  32.68 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  28.57 
 
 		 263 aa  125  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  28.85 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  28.46 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.46 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  28.46 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  28.46 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  28.46 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  28.46 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 267 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  27.38 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  27.35 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  29.61 
 
 		 308 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  27.35 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  28.08 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  28.08 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  28.08 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  28.08 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  28.08 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  29.67 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  27.69 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  30.49 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.7 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 267 aa  105  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.32 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.51 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  29.27 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  25.87 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  25.91 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  26.92 
 
 		 263 aa  98.6  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  26.54 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  26.15 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  26.15 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  28.05 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  24.7 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  26.15 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 268 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  26.54 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  27.16 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  25.69 
 
 		 258 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0866  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 260 aa  88.6  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0543323  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  29.69 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  23.66 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  27.91 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  24.6 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  24.6 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  24.6 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  24.6 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  24.6 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  27.82 
 
 		 268 aa  86.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 273 aa  85.5  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  27.23 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  28.92 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  28.92 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  24.88 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  23.51 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  26.09 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>