More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0866 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0866  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0543323  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51205  putative transcriptional regulator  39.27 
 
 		 266 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00609601  hitchhiker  0.00000763207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4370  IclR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 293 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1882  IclR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 274 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0607  IclR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171658  normal  0.119354 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1226  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.561168  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4574  IclR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0696248  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  27.48 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 268 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 258 aa  92  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  31.13 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.21 
 
 		 280 aa  89.4  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1395  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000767969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  25.95 
 
 		 260 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 262 aa  86.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  26.79 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 263 aa  85.5  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  22.48 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  25.95 
 
 		 260 aa  85.1  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  28.51 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  24.37 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  24.37 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  29.13 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  26.19 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  23.69 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  24.71 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  27.73 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  27.15 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  26.5 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  24.49 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  25.39 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  25.7 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1057  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  27.62 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  24.4 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  25.34 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  27.71 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  30.26 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  26.48 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  28.11 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  29.22 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0516  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  27.23 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  27.39 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  25.52 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.52 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  25.52 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.52 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  23.68 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  25.52 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.52 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  27.83 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  27.98 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2520  putative transcriptional regulator  24.9 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2428  putative transcriptional regulator  24.9 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  25.98 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  23.79 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2532  putative transcriptional regulator  24.9 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.221562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  29.86 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  25.82 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>