More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4402 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 256 aa  493  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  68.16 
 
 		 274 aa  273  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  56.13 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  55.34 
 
 		 277 aa  247  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  54.72 
 
 		 259 aa  242  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  55.24 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  52.16 
 
 		 253 aa  235  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3621  transcriptional regulator, IclR family  56.35 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  46.85 
 
 		 291 aa  209  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1420  transcriptional regulator, IclR family  51.35 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.956914 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04160  transcriptional regulator, IclR family  53.7 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30720  transcriptional regulator  60.38 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  27.91 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  31.05 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  33.74 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  29.39 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  29.39 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  29.39 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  29.39 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 283 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  29.39 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  29.39 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  29.39 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  29.39 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  31.7 
 
 		 308 aa  96.3  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  28.35 
 
 		 277 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  31.15 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  31.15 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  28.7 
 
 		 276 aa  95.9  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.88 
 
 		 252 aa  95.5  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 284 aa  95.1  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  32.29 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.497587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  29.46 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  29.07 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 285 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  28.89 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  29.07 
 
 		 274 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  32.27 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  29.07 
 
 		 274 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  29.07 
 
 		 274 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  29.07 
 
 		 274 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  29.07 
 
 		 274 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  26.27 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.26 
 
 		 261 aa  92  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 275 aa  92  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4206  transcriptional regulator, IclR family  34.55 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 285 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  28.44 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 285 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  31.53 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.81 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  32.67 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  36.02 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.75 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  36.02 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  33.33 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.33 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  32.02 
 
 		 266 aa  89  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  35.07 
 
 		 257 aa  89.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 256 aa  88.6  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 302 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3480  transcriptional regulator, IclR family  23.32 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  34.42 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 271 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  33.16 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  27.56 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  27.56 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  30.65 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  27.56 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>