More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3711 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
257 aa  505  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  45.76 
 
 
260 aa  185  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  45.23 
 
 
260 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  44.4 
 
 
266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  36.24 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  38.84 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 
262 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  34.84 
 
 
265 aa  139  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  36.73 
 
 
280 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  37.78 
 
 
257 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  36.36 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0484  IclR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0371471  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  37.78 
 
 
252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  35.89 
 
 
252 aa  132  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  35.29 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  36.32 
 
 
251 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  40.17 
 
 
281 aa  132  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  36.67 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  37.67 
 
 
261 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
251 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  37.34 
 
 
248 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  34.48 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  37.81 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0759  transcriptional regulator, IclR family  38.07 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
260 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 
259 aa  125  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
261 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2092  transcriptional regulator, IclR family  38.36 
 
 
270 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321928 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  35.56 
 
 
261 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  38.02 
 
 
308 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  32.66 
 
 
274 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  32.66 
 
 
274 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  32.66 
 
 
274 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  32.66 
 
 
274 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  32.66 
 
 
274 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  32.66 
 
 
274 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  32.66 
 
 
274 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 
260 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  33.46 
 
 
295 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  32.66 
 
 
274 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  34.2 
 
 
263 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
260 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 
260 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 
256 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  37.12 
 
 
256 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  33.6 
 
 
273 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
252 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
262 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  32.26 
 
 
274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  32.26 
 
 
274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  32.26 
 
 
274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  32.26 
 
 
274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  32.26 
 
 
274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4406  IclR family transcriptional regulator  36.12 
 
 
258 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.41646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.98 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  31.98 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  31.98 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  31.98 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  31.98 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 
279 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  31.98 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  31.98 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  32.26 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  33.74 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  36.56 
 
 
253 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  32.37 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  31.58 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
284 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  32.44 
 
 
257 aa  115  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
275 aa  115  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  34.2 
 
 
275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  35.39 
 
 
550 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 
253 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  31.98 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  31.98 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  31.98 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  31.98 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  31.98 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  31.09 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  33.33 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  35.71 
 
 
249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  31.69 
 
 
263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  31.69 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>