More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3621 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3621  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 254 aa  494  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  62.99 
 
 		 259 aa  292  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  65.08 
 
 		 253 aa  292  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  58.37 
 
 		 256 aa  238  9e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 		 275 aa  226  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  50.39 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1420  transcriptional regulator, IclR family  55.38 
 
 		 269 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.956914 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  56.88 
 
 		 274 aa  217  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  48.78 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  45.34 
 
 		 291 aa  189  4e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04160  transcriptional regulator, IclR family  50.92 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30720  transcriptional regulator  51.95 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 278 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  34.24 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  28.4 
 
 		 276 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28.74 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28.74 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28.74 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 285 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  29.72 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  27.89 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  27.89 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  27.89 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  27.89 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  27.89 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  27.89 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  27.89 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  27.89 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  28.63 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 272 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  33.87 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  29.02 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  35.64 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  35.64 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  29.84 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 318 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  27.27 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  27.49 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  27.49 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  27.49 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  27.49 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  27.49 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  34.27 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.53 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  27.89 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2402  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 260 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02174  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.04 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1410  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02133  hypothetical protein  30.04 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1401  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.509968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  31.93 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2390  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 267 aa  99  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  27.67 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4206  transcriptional regulator, IclR family  37.1 
 
 		 293 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3389  transcriptional regulator, IclR family, C-terminal domain  29.64 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  26.21 
 
 		 254 aa  98.6  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  25.82 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  31.28 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 284 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 284 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 284 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.32 
 
 		 295 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 284 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 284 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 284 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 284 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 284 aa  95.9  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2520  putative transcriptional regulator  29.48 
 
 		 260 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2428  putative transcriptional regulator  29.48 
 
 		 260 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2477  putative transcriptional regulator  29.48 
 
 		 259 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  26.56 
 
 		 294 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2532  putative transcriptional regulator  29.48 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.221562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  31.89 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  33.02 
 
 		 276 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>