More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5595 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  95.79 
 
 		 285 aa  554  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  94.74 
 
 		 285 aa  543  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  94.39 
 
 		 285 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  92.28 
 
 		 284 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  83.51 
 
 		 284 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  83.51 
 
 		 284 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  83.51 
 
 		 284 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  83.51 
 
 		 284 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  83.51 
 
 		 284 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  83.51 
 
 		 284 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  83.51 
 
 		 284 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  83.51 
 
 		 284 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  75 
 
 		 286 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  72.14 
 
 		 294 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  73.21 
 
 		 294 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  66.17 
 
 		 324 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  65.7 
 
 		 318 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  67.45 
 
 		 324 aa  349  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  64.73 
 
 		 298 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  63.08 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  64.36 
 
 		 298 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  64.36 
 
 		 298 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  62.63 
 
 		 314 aa  341  9e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 297 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  62.28 
 
 		 314 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 316 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 316 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 316 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 316 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 316 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 316 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 316 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  65.12 
 
 		 316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  56.81 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  53.52 
 
 		 275 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  53.52 
 
 		 275 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  53.53 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  53.41 
 
 		 274 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  50.79 
 
 		 278 aa  238  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30.62 
 
 		 260 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  29.96 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 267 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 260 aa  125  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  29.57 
 
 		 260 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  31.92 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  30.35 
 
 		 265 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  29.57 
 
 		 260 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3600  regulatory protein, IclR  32.84 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  29.08 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  34.22 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  31.33 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  29.78 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 272 aa  112  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  31.51 
 
 		 259 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  28.35 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.56 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  29.77 
 
 		 267 aa  109  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 267 aa  109  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.46 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  27.09 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  32.55 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.34 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  30.12 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4406  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  29.44 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  26.64 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  30.12 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>