More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0818 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
276 aa  560  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3600  regulatory protein, IclR  41.57 
 
 
278 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0480  IclR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
259 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220206  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
278 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  34.39 
 
 
275 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  34.39 
 
 
275 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  34.35 
 
 
278 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
274 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
298 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
298 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
298 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
310 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
316 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
316 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
297 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
316 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
316 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
314 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
316 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
316 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
316 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
316 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
314 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  32.82 
 
 
294 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  33.84 
 
 
324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 
324 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
294 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
318 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
285 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
285 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
285 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
284 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  35.57 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
268 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
284 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
284 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
284 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
284 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
284 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
284 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
284 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  35.78 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
279 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  32.34 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  32.47 
 
 
291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 
259 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  35.24 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  33.21 
 
 
268 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  33.2 
 
 
278 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
272 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
275 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.25 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  33.85 
 
 
293 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  33.85 
 
 
266 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
260 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  29.25 
 
 
280 aa  112  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3621  transcriptional regulator, IclR family  34.63 
 
 
254 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  32.11 
 
 
251 aa  112  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  27.71 
 
 
252 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  26.18 
 
 
278 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  32.42 
 
 
264 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
267 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
267 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  30.48 
 
 
267 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.96 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
267 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
295 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  29.63 
 
 
269 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.69 
 
 
252 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  26.69 
 
 
275 aa  105  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  28.3 
 
 
269 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
274 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  31.51 
 
 
254 aa  105  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
269 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0499083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>