More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1420 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1420  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 269 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.956914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  59.46 
 
 		 259 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  56.22 
 
 		 253 aa  231  7.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  52.85 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3621  transcriptional regulator, IclR family  55.38 
 
 		 254 aa  219  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  54.63 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  50.46 
 
 		 254 aa  202  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  44.98 
 
 		 277 aa  199  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  47.71 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04160  transcriptional regulator, IclR family  49.77 
 
 		 249 aa  185  9e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30720  transcriptional regulator  48.47 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  32.18 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  32.18 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  35.63 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  29.01 
 
 		 275 aa  108  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  29.01 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  29.01 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  29.01 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  29.01 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  29.01 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.48 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  28.24 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  28.24 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  28.24 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  28.24 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  28.24 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  28.24 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  28.24 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  30.83 
 
 		 251 aa  99  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 316 aa  98.6  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.29 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  29.34 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  28.63 
 
 		 277 aa  95.9  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.3 
 
 		 256 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.3 
 
 		 256 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  26.72 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  26.72 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  26.72 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  28.83 
 
 		 294 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  29.01 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  25.93 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.93 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  25.93 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.93 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.93 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.74 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  37.14 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  25.57 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  25.93 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  37.14 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.93 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 246 aa  93.2  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  25.81 
 
 		 246 aa  93.2  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  27.86 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  25.95 
 
 		 277 aa  92.4  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 280 aa  92.4  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  31.3 
 
 		 273 aa  92  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 324 aa  92  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  30.47 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  29.86 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  29 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>