More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30720 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_30720  transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  577  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  62.13 
 
 		 275 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  64.94 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  67.32 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  60.38 
 
 		 254 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  60.38 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  48.04 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  53.21 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  50.33 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04160  transcriptional regulator, IclR family  57.14 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1420  transcriptional regulator, IclR family  48.77 
 
 		 269 aa  142  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.956914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3621  transcriptional regulator, IclR family  51.95 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.76 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439983  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  32.03 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  36.8 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  33.79 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  31.18 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4206  transcriptional regulator, IclR family  34.27 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  35.95 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  32.47 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  27.67 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  32.03 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  32.03 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4376  transcriptional regulator, IclR family  31.79 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3480  transcriptional regulator, IclR family  22.58 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  30.19 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0697  IclR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.734635  decreased coverage  0.00216711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  33.1 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  33.13 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2795  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  32.03 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  32.47 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  35.92 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28.37 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  33.58 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.29 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  27.85 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7060  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.579294  normal  0.280018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  36.23 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.45 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20720  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439734  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  31.61 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  32.43 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>