More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4038 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  56.91 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  54.85 
 
 		 266 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  53.19 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  49.79 
 
 		 252 aa  208  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  48.5 
 
 		 281 aa  201  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  45.76 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0759  transcriptional regulator, IclR family  44.08 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2092  transcriptional regulator, IclR family  42.86 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321928 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0484  IclR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  39.52 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  41.83 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  43.09 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  41.95 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  42.54 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  42.29 
 
 		 276 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  38.89 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  34.73 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  40.43 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  39.32 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  40.89 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  35.11 
 
 		 261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  39.74 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  37.71 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  32 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  41.21 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  41.21 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  34.66 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  34.26 
 
 		 276 aa  128  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  35.25 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  35.25 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  35.25 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  34.52 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  35.25 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  35.25 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  35.25 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  35.25 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  34.52 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  34.52 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  35.25 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  36.89 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  32.51 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  33.62 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  36.07 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  36.07 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  36.07 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  36.07 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  36.07 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  35.5 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  36.61 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  38.2 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  33.63 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  34.43 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  33.8 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  34.43 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  34.57 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  33.74 
 
 		 277 aa  119  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  32.58 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  31.56 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4206  transcriptional regulator, IclR family  38.6 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  33.47 
 
 		 263 aa  118  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  35.27 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  39.41 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.19 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  33.19 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  33.19 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  33.19 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  33.19 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  33.19 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  33.19 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  32.73 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  31.11 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  30.97 
 
 		 265 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  33.6 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  34.54 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.56 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  32.58 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  32.33 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>